РАСЧЕТ ПОДВИЖНОСТИ И ЭНТРОПИИ СВЯЗЫВАНИЯ МОЛЕКУЛ В КРИСТАЛЛАХ
Разработан простой метод численной оценки диапазона (размаха) движений молекул в кристаллах. Эта оценка, позволяющая рассчитать энтропию связывания молекул (в частности, в комплексах белок-лиганд), основана на экспериментальных данных по энтальпии сублимации и по давлению насыщенного пара для 15 органических кристаллов, плавящихся при температуре 25–80°С. Для этого набора проведен расчет среднего размаха (и соответствующей этому размаху средней амплитуды) движений молекул в кристалле, оказавшихся равными 0.75 ± 0.14 и 0.18 ± 0.03 Å соответственно. Рассчитанная на основе среднего размаха движений молекул в кристалле энтропия сублимации показала хорошее совпадение с экспериментальными данными.
A simple method is developed for evaluation of the range of molecular movements in crystals. This estimate, needed for calculation of the binding entropy (in particular, in protein-ligand complexes), is based on experimental data on the enthalpy of sublimation and pressure of the saturated vapor for 15 organic crystals which melt at temperatures 25–80°С...
A simple method is developed for evaluation of the range of molecular movements in crystals. This estimate, needed for calculation of the binding entropy (in particular, in protein-ligand complexes), is based on experimental data on the enthalpy of sublimation and pressure of the saturated vapor for 15 organic crystals which melt at temperatures 25–80°С. For this set, we calculated the mean range and the corresponding mean amplitude of molecular movements in crystals, which value turned out to be 0.75 ± 0.14 and 0.18 ± 0.03 Å, correspondingly. The entropy of sublimation calculated on the basis of the mean range of molecular movements in crystal has shown a good agreement with the experimental data. Keywords: sublimation entropy, range of molecular movements in crystal, amplitude of movements, sublimation enthalpy, molecular crystals, computational chemistry and biochemistry.